Xueyd's Blog

MeRIP-seq数据分析之peak calling

发表于 2022-11-28 分类于 m6A-seq
本文字数： 1.1k 阅读时长 ≈ 1 分钟

m6A-seq上游的数据处理流程和Ribo-seq差不多，包括去接头、数据质控、比对。比对之前也有文献会对m6A-seq数据去rRNA、tRNA，根据需求处理即可，这里不再总结，直接从得到比对的结果之后开始。

发表于 2022-11-25 更新于 2022-11-30 分类于 Python
本文字数： 653 阅读时长 ≈ 1 分钟

本文总结Pandas中常用的统计学函数。

发表于 2022-11-23 更新于 2023-04-18 分类于 R
本文字数： 150 阅读时长 ≈ 1 分钟

R语言处理数据中的0值和NA值。

发表于 2022-11-23 分类于 R
本文字数： 108 阅读时长 ≈ 1 分钟

Mfuzz能够识别表达谱潜在的时间序列模式，并将具有相似表达模式的基因进行聚类。
本文介绍Mfuzz包的使用。

发表于 2022-11-22 更新于 2022-11-23 分类于 R
本文字数： 147 阅读时长 ≈ 1 分钟

本文介绍利用tidyverse包的select()函数和sqldf包的sqldf()选择数据框的列。