0%

  • SeuratObject数据结构
    • Assays
    • meta.data
    • active.assay
    • active.ident
    • reduction
  • 提取数据
    • 提取基因ID和细胞ID
    • 提取细胞坐标信息
    • 提取表达矩阵
    • 提取平均表达量
    • 聚类细胞数目与比例统计
    • 修改聚类后的idents
    • 提取部分Seurat对象
      阅读全文 »

很多情况下,我们需要将多个sample dataset合并在一起,然后进行接下来的分析。Seurat v4官方提供了可以用于整合数据集的函数:FindIntegrationAnchors()和IntegrateData()。

阅读全文 »